Как правильно выбрать код специальности при вводе сведений о работниках, если в списке есть только бакалавр и магистр, а у меня специалитет?

Используйте код специальности ‘05’ для специалитета. Коды для других уровней: бакалавриат – ‘03’, магистратура – ‘04’. Для точного выбора кода рекомендуется сверяться с Общероссийским классификатором специальностей по образованию.