Можно ли оплачивать государственную пошлину за регистрацию деклараций через личный кабинет от одного юридического лица, а регистрировать декларации от другого?

Оплата государственной пошлины списывается с того юридического лица, которое осуществляет регистрацию деклараций. Следовательно, если регистрация деклараций проводится от ООО, оплата должна осуществляться с расчетного счета ООО, а не ИП.